MaskRCNN-Benchmark框架训练自己的数据集


Facebook AI Research 开源了 Faster R-CNN 和 Mask R-CNN 的 PyTorch 1.0 实现基准:MaskRCNN-Benchmark。相比 Detectron 和 mmdetection,MaskRCNN-Benchmark 的性能相当,并拥有更快的训练速度和更低的 GPU 内存占用。

众多亮点如下:
PyTorch 1.0:相当或者超越 Detectron 准确率的 RPN、Faster R-CNN、Mask R-CNN 实现;
非常快:训练速度是 Detectron 的两倍,是 mmdection 的 1.3 倍。
节省内存:在训练过程中使用的 GPU 内存比 mmdetection 少大约 500MB;
使用多 GPU 训练和推理;
批量化推理:可以在每 GPU 每批量上使用多张图像进行推理;
支持 CPU 推理:可以在推理时间内于 CPU 上运行。
提供几乎所有参考 Mask R-CNN 和 Faster R-CNN 配置的预训练模型,具有 1x 的 schedule。

运行基础环境:
系统:Ubutun 16.04
Python环境:Anaconda3 | Python 3.6.5 | CUDA

$ conda create --name maskrcnn_benchmark
$ source activate maskrcnn_benchmark

$ conda install ipython
$ pip install ninja yacs cython matplotlib tqdm opencv-python

# follow PyTorch installation in https://pytorch.org/get-started/locally/
# we give the instructions for CUDA 9.0
$ conda install -c pytorch pytorch-nightly torchvision cudatoolkit=9.0

# install pycocotools
$ cd ~/github
$ git clone https://github.com/cocodataset/cocoapi.git
$ cd cocoapi/PythonAPI
$ python setup.py build_ext install

# install apex
cd ~/github
git clone https://github.com/NVIDIA/apex.git
cd apex
python setup.py install --cuda_ext --cpp_ext

# install PyTorch Detection
$ cd ~/github
$ git clone https://github.com/facebookresearch/maskrcnn-benchmark.git
$ cd maskrcnn-benchmark
$ python setup.py build develop

关于执行途中报错请看文章末尾。

install apex执行编译输出:

(maskrcnn_benchmark) xxx@xxx:~/github/apex$ python setup.py install --cuda_ext --cpp_ext
torch.__version__  =  1.0.0
setup.py:43: UserWarning: Option --pyprof not specified. Not installing PyProf dependencies!
  warnings.warn("Option --pyprof not specified. Not installing PyProf dependencies!")

Compiling cuda extensions with
nvcc: NVIDIA (R) Cuda compiler driver
Copyright (c) 2005-2017 NVIDIA Corporation
Built on Fri_Sep__1_21:08:03_CDT_2017
Cuda compilation tools, release 9.0, V9.0.176
from /usr/local/cuda-9.0/bin
...

一、数据集准备

COCO数据集下载:https://blog.csdn.net/qq_41847324/article/details/86224628,这位博主写的非常详细。
自定义数据集如下:
COCO数据集现在有3种标注类型:
object instances(目标实例),
object keypoints(目标上的关键点)
image captions(看图说话)
使用JSON文件存储。具体可以参考COCO数据集的标注格式一文。我用到object detection,不需要语义分割,格式相对简单。

{
	"info": {..}          #描述这个数据集的整体信息,训练自己的数据直接给个空词典ok
	"licenses": [license],#可以包含多个licenses实例,训练自己的数据继续给个空列表ok
	"images": [
        {
            'file_name': 'xx', #文件路径,这个路径将和一个将root的根目录拼接成你的文件访问路径
            'height': xx,      #图片高度
            'width': xx,       #图片宽度
            'id': xx,          #每张图片都有一个唯一的id,从0开始编码即可
        },
        ...
    ],
	"annotations": [
        {
            'segmentation': [] #语义分割的时候要用到,我只用到了目标检测,所以忽略.
            'area': xx,        #区域面积,宽*高就是区域面积
            'image_id': xx,    #一张当然可能有多个标注,这个image_id和images中的id相对应
            'bbox':[x,y,w,h],  #通过这4个坐标来定位边框
            'category_id': xx, #类别id(与categories中的id对应)
            'id': xx,          #这是这个annotation的id,也是唯一的,从0编号即可
        },
        ...
    ]
	"categories": [
        {
            'supercategory': xx, #你类别名称,例如vehicle(交通工具),下一级有car,truck等. 
            'id': xx,            #类别的id,从1开始编号,0默认为背景
            'name': xx,          #这个子类别的名字
        },
        ...
    ],
}

参照上面的标注格式分别生成训练集和验证集的json标注文件,可以继续沿用coco数据集默认的名字:instances_train2104.json和instances_val2014.json。数据集的目录组织结构可以参考下面的整体目录结构中datasets目录。
数据集校验:https://www.zhihu.com/search?q=maskrcnn%20benchmark&utm_content=search_suggestion&type=content

(maskrcnn_benchmark)xxx@xxx~$ tree -L 3
.
├── configs
│   ├── e2e_faster_rcnn_R_101_FPN_1x.yaml #训练和验证要用到的faster r-cnn模型配置文件
│   ├── e2e_mask_rcnn_R_101_FPN_1x.yaml   #训练和验证要用到的mask r-cnn模型配置文件
│   └── quick_schedules
├── CONTRIBUTING.md
├── datasets
│   └── coco
│       ├── annotations
│  		│  ├── instances_train2014.json #训练集标注文件
│  		│  └── instances_val2014.json   #验证集标注文件
│       ├── train2014  #存放训练集图片
│       └── val2014    #存放验证集图片
├── maskrcnn_benchmark
│   ├── config
│   │   ├── defaults.py #masrcnn_benchmark默认配置文件,启动时会读取訪配置文件,configs目录下的模型配置文件进行参数合并
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── paths_catalog.py #在訪文件中配置训练和测试集的路径
│   │   └── __pycache__
│   ├── csrc
│   ├── data
│   │   ├── build.py #生成数据集的地方
│   │   ├── datasets #訪目录下的coco.py提供了coco数据集的访问接口
│   │   └── transforms
│   ├── engine
│   │   ├── inference.py #验证引擎
│   │   └── trainer.py   #训练引擎
│   ├── __init__.py
│   ├── layers
│   │   ├── batch_norm.py
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── misc.py
│   │   ├── nms.py
│   │   ├── __pycache__
│   │   ├── roi_align.py
│   │   ├── roi_pool.py
│   │   ├── smooth_l1_loss.py
│   │   └── _utils.py
│   ├── modeling
│   │   ├── backbone
│   │   ├── balanced_positive_negative_sampler.py
│   │   ├── box_coder.py
│   │   ├── detector
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── matcher.py
│   │   ├── poolers.py
│   │   ├── __pycache__
│   │   ├── roi_heads
│   │   ├── rpn
│   │   └── utils.py
│   ├── solver
│   │   ├── build.py
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── lr_scheduler.py #在此设置学习率调整策略
│   │   └── __pycache__
│   ├── structures
│   │   ├── bounding_box.py
│   │   ├── boxlist_ops.py
│   │   ├── image_list.py
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── __pycache__
│   │   └── segmentation_mask.py
│   └── utils
│       ├── c2_model_loading.py
│       ├── checkpoint.py #检查点
│       ├── __init__.py
│       ├── logger.py #日志设置
│       ├── model_zoo.py
│       ├── __pycache__
│       └── README.md
├── output #我自己设定的输出目录
├── tools
│   ├── test_net.py  #验证入口
│   └── train_net.py #训练入口
└── TROUBLESHOOTING.md

二、配置文件

  • 模型配置文件(如:configs/e2e_mask_rcnn_R_101_FPN_1x.yaml)
  • 数据路径配置文件(maskrcnn_benchmark/config/paths_catalog.py)
  • MaskRCNN-Benchmark框架配置文件(maskrcnn_benchmark/config/defaults.py)。

模型配置文件在启动训练时由--config-file参数指定,在config子目录下默认提供了mask_rcnn和faster_rcnn框架不同骨干网的基于YAML格式的配置文件。这里选用e2e_mask_rcnn_R_101_FPN_1x.yaml,也就是使用mask_rcnn检测模型,骨干网络ResNet101-FPN,配置详情如下(根据自己的数据集作相应的调整):

MODEL:
  META_ARCHITECTURE: "GeneralizedRCNN"
  WEIGHT: "catalog://ImageNetPretrained/MSRA/R-101" # 若为空,则直接训练
  BACKBONE:
    CONV_BODY: "R-101-FPN"
    OUT_CHANNELS: 256
  RPN:
    USE_FPN: True #是否使用FPN,也就是特征金字塔结构,选择True将在不同的特征图提取候选区域
    ANCHOR_STRIDE: (4, 8, 16, 32, 64) #ANCHOR的步长
    PRE_NMS_TOP_N_TRAIN: 2000         #训练时,NMS之前的候选区数量
    PRE_NMS_TOP_N_TEST: 1000          #测试时,NMS之后的候选区数量
    POST_NMS_TOP_N_TEST: 1000
    FPN_POST_NMS_TOP_N_TEST: 1000
  ROI_HEADS:
    USE_FPN: True
  ROI_BOX_HEAD:
    POOLER_RESOLUTION: 7
    POOLER_SCALES: (0.25, 0.125, 0.0625, 0.03125)
    POOLER_SAMPLING_RATIO: 2
    FEATURE_EXTRACTOR: "FPN2MLPFeatureExtractor"
    PREDICTOR: "FPNPredictor"
  ROI_MASK_HEAD:
    POOLER_SCALES: (0.25, 0.125, 0.0625, 0.03125)
    FEATURE_EXTRACTOR: "MaskRCNNFPNFeatureExtractor"
    PREDICTOR: "MaskRCNNC4Predictor"
    POOLER_RESOLUTION: 14
    POOLER_SAMPLING_RATIO: 2
    RESOLUTION: 28
    SHARE_BOX_FEATURE_EXTRACTOR: False
  MASK_ON: False              #默认是True,我这里改为False,因为我没有用到语义分割的功能
DATASETS:
  TRAIN: ("coco_2014_train",) #注意这里的训练集和测试集的名字,
  TEST: ("coco_2014_val",)    #它们和paths_catalog.py中DATASETS相对应
DATALOADER:
  SIZE_DIVISIBILITY: 32
SOLVER:
  BASE_LR: 0.01             #起始学习率,学习率的调整有多种策略,訪框架自定义了一种策略
  WEIGHT_DECAY: 0.0001
  #这是什么意思呢?是为了在不同的迭代区间进行学习率的调整而设定的.以我的数据集为例,
  #我149898张图,计划是每4个epoch衰减一次,所以如下设置.
  STEPS: (599592, 1199184) 
  MAX_ITER: 1300000 #最大迭代次数

看完模型配置文件,你再看看MaskRCNN-Benchmark框架默认配置文件(defaults.py)你就会发现有不少参数有重合。嘿嘿,阅读代码会发现defaults.py会合并模型配置文件中的参数,defaults.py顾名思义就是提供了默认的参数配置,如果模型配置文件中对訪参数有改动则以模型中的为准。

import os
from yacs.config import CfgNode as CN
_C = CN()
_C.MODEL = CN()
_C.MODEL.RPN_ONLY = False
_C.MODEL.MASK_ON = False
_C.MODEL.DEVICE = "cuda" 
_C.MODEL.META_ARCHITECTURE = "GeneralizedRCNN"
_C.MODEL.WEIGHT = ""

_C.INPUT = CN()
# 先检验训练集图片的大小来相应的修改,否则会造成内存溢出。
_C.INPUT.MIN_SIZE_TRAIN = 800  #训练集图片最小尺寸
_C.INPUT.MAX_SIZE_TRAIN = 1333 #训练集图片最大尺寸
_C.INPUT.MIN_SIZE_TEST = 800
_C.INPUT.MAX_SIZE_TEST = 1333
_C.INPUT.PIXEL_MEAN = [102.9801, 115.9465, 122.7717]
_C.INPUT.PIXEL_STD = [1., 1., 1.]
_C.INPUT.TO_BGR255 = True
_C.DATASETS = CN()
_C.DATASETS.TRAIN = ()        #在模型配置文件中已给出
_C.DATASETS.TEST = ()
_C.DATALOADER = CN()
_C.DATALOADER.NUM_WORKERS = 4 #数据生成启线程数
_C.DATALOADER.SIZE_DIVISIBILITY = 0
_C.DATALOADER.ASPECT_RATIO_GROUPING = True
_C.MODEL.BACKBONE = CN()
_C.MODEL.BACKBONE.CONV_BODY = "R-50-C4"
_C.MODEL.BACKBONE.FREEZE_CONV_BODY_AT = 2
_C.MODEL.BACKBONE.OUT_CHANNELS = 256 * 4
_C.MODEL.RPN = CN()
_C.MODEL.RPN.USE_FPN = False
_C.MODEL.RPN.ANCHOR_SIZES = (32, 64, 128, 256, 512)
_C.MODEL.RPN.ANCHOR_STRIDE = (16,)
_C.MODEL.RPN.ASPECT_RATIOS = (0.5, 1.0, 2.0)
_C.MODEL.RPN.STRADDLE_THRESH = 0
_C.MODEL.RPN.FG_IOU_THRESHOLD = 0.7
_C.MODEL.RPN.BG_IOU_THRESHOLD = 0.3
_C.MODEL.RPN.BATCH_SIZE_PER_IMAGE = 256
_C.MODEL.RPN.POSITIVE_FRACTION = 0.5
_C.MODEL.RPN.PRE_NMS_TOP_N_TRAIN = 12000
_C.MODEL.RPN.PRE_NMS_TOP_N_TEST = 6000
_C.MODEL.RPN.POST_NMS_TOP_N_TRAIN = 2000
_C.MODEL.RPN.POST_NMS_TOP_N_TEST = 1000
_C.MODEL.RPN.NMS_THRESH = 0.7
_C.MODEL.RPN.MIN_SIZE = 0
_C.MODEL.RPN.FPN_POST_NMS_TOP_N_TRAIN = 2000
_C.MODEL.RPN.FPN_POST_NMS_TOP_N_TEST = 2000
_C.MODEL.ROI_HEADS = CN()
_C.MODEL.ROI_HEADS.USE_FPN = False
_C.MODEL.ROI_HEADS.FG_IOU_THRESHOLD = 0.5
_C.MODEL.ROI_HEADS.BG_IOU_THRESHOLD = 0.5
_C.MODEL.ROI_HEADS.BBOX_REG_WEIGHTS = (10., 10., 5., 5.)
_C.MODEL.ROI_HEADS.BATCH_SIZE_PER_IMAGE = 512
_C.MODEL.ROI_HEADS.POSITIVE_FRACTION = 0.25
_C.MODEL.ROI_HEADS.SCORE_THRESH = 0.05
_C.MODEL.ROI_HEADS.NMS = 0.5
_C.MODEL.ROI_HEADS.DETECTIONS_PER_IMG = 100
_C.MODEL.ROI_BOX_HEAD = CN()
_C.MODEL.ROI_BOX_HEAD.FEATURE_EXTRACTOR = "ResNet50Conv5ROIFeatureExtractor"
_C.MODEL.ROI_BOX_HEAD.PREDICTOR = "FastRCNNPredictor"
_C.MODEL.ROI_BOX_HEAD.POOLER_RESOLUTION = 14
_C.MODEL.ROI_BOX_HEAD.POOLER_SAMPLING_RATIO = 0
_C.MODEL.ROI_BOX_HEAD.POOLER_SCALES = (1.0 / 16,)
#数据集类别数,默认是81,因为coco数据集为80+1(背景),我的数据集只有4个类别,加上背景也就是5个类别
_C.MODEL.ROI_BOX_HEAD.NUM_CLASSES = 5
_C.MODEL.ROI_BOX_HEAD.MLP_HEAD_DIM = 1024
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD = CN()
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD.FEATURE_EXTRACTOR = "ResNet50Conv5ROIFeatureExtractor"
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD.PREDICTOR = "MaskRCNNC4Predictor"
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD.POOLER_RESOLUTION = 14
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD.POOLER_SAMPLING_RATIO = 0
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD.POOLER_SCALES = (1.0 / 16,)
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD.MLP_HEAD_DIM = 1024
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD.CONV_LAYERS = (256, 256, 256, 256)
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD.RESOLUTION = 14
_C.MODEL.ROI_MASK_HEAD.SHARE_BOX_FEATURE_EXTRACTOR = True
_C.MODEL.RESNETS = CN()
_C.MODEL.RESNETS.NUM_GROUPS = 1
_C.MODEL.RESNETS.WIDTH_PER_GROUP = 64
_C.MODEL.RESNETS.STRIDE_IN_1X1 = True
_C.MODEL.RESNETS.TRANS_FUNC = "BottleneckWithFixedBatchNorm"
_C.MODEL.RESNETS.STEM_FUNC = "StemWithFixedBatchNorm"
_C.MODEL.RESNETS.RES5_DILATION = 1
_C.MODEL.RESNETS.RES2_OUT_CHANNELS = 256
_C.MODEL.RESNETS.STEM_OUT_CHANNELS = 64
_C.SOLVER = CN()
_C.SOLVER.MAX_ITER = 40000 #最大迭代次数
_C.SOLVER.BASE_LR = 0.02   #初始学习率,这个通常在模型配置文件中有设置
_C.SOLVER.BIAS_LR_FACTOR = 2
_C.SOLVER.MOMENTUM = 0.9
_C.SOLVER.WEIGHT_DECAY = 0.0005
_C.SOLVER.WEIGHT_DECAY_BIAS = 0
_C.SOLVER.GAMMA = 0.1
_C.SOLVER.STEPS = (30000,)
_C.SOLVER.WARMUP_FACTOR = 1.0 / 3
_C.SOLVER.WARMUP_ITERS = 500         #预热迭代次数,预热迭代次数内(小于訪值)的学习率比较低
_C.SOLVER.WARMUP_METHOD = "constant" #预热策略,有'constant'和'linear'两种
_C.SOLVER.CHECKPOINT_PERIOD = 2000   #生成检查点(checkpoint)的步长
_C.SOLVER.IMS_PER_BATCH = 1          #一个batch包含的图片数量
_C.TEST = CN()
_C.TEST.EXPECTED_RESULTS = []
_C.TEST.EXPECTED_RESULTS_SIGMA_TOL = 4
_C.TEST.IMS_PER_BATCH = 1
_C.OUTPUT_DIR = "output"             #主要作为checkpoint和inference的输出目录
_C.PATHS_CATALOG = os.path.join(os.path.dirname(__file__), "paths_catalog.py")

关于path_catalog其实最重要的就是DatasetCatalog这个类。

class DatasetCatalog(object):
    DATA_DIR = "datasets"
 
    DATASETS = {
        "coco_2014_train": (
            "coco/train2014", #这里是訪数据集的主目录,称其为root,訪root会和标注文件中images字段中的file_name指定的路径进行拼接得到图片的完整路径
            "coco/annotations/instances_train2014.json", # 标注文件路径
        ),
        "coco_2014_val": (
            "coco/val2014", #同上
            "coco/annotations/instances_val2014.json" #同上
        ),
    }
 
    @staticmethod
    def get(name):
        if "coco" in name: #e.g. "coco_2014_train"
            data_dir = DatasetCatalog.DATA_DIR
            attrs = DatasetCatalog.DATASETS[name]
            args = dict(
                root=os.path.join(data_dir, attrs[0]),
                ann_file=os.path.join(data_dir, attrs[1]),
            )
            return dict(
                factory="COCODataset",
                args=args,
            )
        raise RuntimeError("Dataset not available: {}".format(name))

三、训练与测试

# 进入maskrcnn-benchmark目录下,激活maskrcnn_benchmark虚拟环境
(base) xxx@xxx:~/github/maskrcnn-benchmark$ source activate maskrcnn_benchmark
(maskrcnn_benchmark) xxx@xxx:~/github/maskrcnn-benchmark$

=============训练模型============
#指定模型配置文件,执行训练启动脚本
(maskrcnn_benchmark) xxx@xxx:~/github/maskrcnn-benchmark$ python tools/train_net.py \
--config-file configs/e2e_mask_rcnn_R_101_FPN_1x.yaml

=============测试模型============
#指定模型配置文件,执行测试启动脚本
(maskrcnn_benchmark) xxx@xxx:~/github/maskrcnn-benchmark$ python tools/test_net.py \
--config-file configs/e2e_mask_rcnn_R_101_FPN_1x.yaml
3.1 报错与解决

执行python setup.py build_ext install报错如下,执行pip install cython解决

gcc: error: pycocotools/_mask.c: 没有那个文件或目录
error: command 'gcc' failed with exit status 1

运行训练时报错:

from maskrcnn_benchmark import _C
ImportError: /home/xxx/github/maskrcnn-benchmark/maskrcnn_benchmark/_C.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so: undefined symbol: _ZN3c1019UndefinedTensorImpl10_singletonE

解决(若执行完pytorch降级还是报错,再尝试执行重新编译):

  • pytorch降级,执行conda install pytorch=1.0.0 -c soumith
    pytorch-1.0.0与torchvision-0.2.1配对。
  • 删除maskrcnn-benchmark下的build文件夹,重新编译。
    rm -rf build
    python setup.py build develop
pytorch-1.0.0离线下载地址:(ubuntu16.04)
https://conda.anaconda.org/soumith/linux-64/pytorch-1.0.0-py3.7_cuda9.0.176_cudnn7.4.1_1.tar.bz2

运行训练时报错:
参考:http://www.sohu.com/a/332756215_473283

AttributeError: module 'torch' has no attribute 'bool'

解决:
修改如下三个文件:
maskrcnn-benchmark/maskrcnn_benchmark/structures/segmentation_mask.py
maskrcnn-benchmark/maskrcnn_benchmark/modeling/balanced_positive_negative_sampler.py
maskrcnn-benchmark/maskrcnn_benchmark/modeling/rpn/inference.py
torch.bool换成torch.uint8
训练执行:python tools/train_net.py --config-file "configs/e2e_mask_rcnn_R_50_FPN_1x.yaml"
在这里插入图片描述

参考与鸣谢
https://yq.aliyun.com/articles/701361
https://blog.csdn.net/ChuiGeDaQiQiu/article/details/83868512
数据集:https://zhuanlan.zhihu.com/p/29393415
训练自己的数据集:https://www.cnblogs.com/yanghailin/p/11214526.html

Mask Scoring RCNN训练自己的数据:https://blog.csdn.net/linolzhang/article/details/97833354
预训练模型https://www.cnblogs.com/houyong/p/10266228.html

MaskRCNN Benchmark 配置问题:https://blog.csdn.net/hankexin1314/article/details/102800908
数据类型修改:https://www.cnblogs.com/jiading/p/12055904.html

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